Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15801-201ENSMUST00000120920 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14679-201ENSMUST00000121536 722 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Bloc1s6os-201ENSMUST00000150154 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23279-201ENSMUST00000157912 97 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm8783-201ENSMUST00000159764 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37381-202ENSMUST00000194643 657 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm5995-201ENSMUST00000204107 1273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm5582-201ENSMUST00000075251 522 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RxraP28700 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Brs3-201ENSMUST00000033464 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16751-201ENSMUST00000142212 1685 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37581-201ENSMUST00000192371 988 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn2r34-201ENSMUST00000173459 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Lama2-207ENSMUST00000189575 4244 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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