Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Kynu-203ENSMUST00000112826 1587 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ms4a13-202ENSMUST00000188464 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm37132-201ENSMUST00000195553 2238 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Vmn1r173-203ENSMUST00000227987 9233 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr590-ps1-201ENSMUST00000118801 898 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ighv1-27-201ENSMUST00000194473 340 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 LOC665443-201ENSMUST00000212284 796 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr915-201ENSMUST00000215191 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Ireb2-201ENSMUST00000034843 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
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PdgfraP26618 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm43588-201ENSMUST00000201862 2298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PdgfraP26618 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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