Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm28242-201ENSMUST00000187274 1492 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm43961-201ENSMUST00000203289 1872 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm10636-201ENSMUST00000197639 2419 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 C630031E19Rik-201ENSMUST00000218114 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Rgs17-204ENSMUST00000131996 8107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC123043.1-201ENSMUST00000221068 645 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Cntn3-202ENSMUST00000203619 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Dhrs9-201ENSMUST00000063690 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm6820-201ENSMUST00000188803 2173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Rabgap1l-202ENSMUST00000028052 6338 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Rbms3-206ENSMUST00000111773 7908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Sptan1P16546 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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