Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp3-212ENSMUST00000174586 6640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 D3Ertd254e-202ENSMUST00000197653 6689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm29332-201ENSMUST00000190829 227 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rb1cc1Q9ESK9 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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