Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Prl2c2-203ENSMUST00000221612 596 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Sel1l2-202ENSMUST00000122367 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm43771-201ENSMUST00000202931 1578 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Tlr13-201ENSMUST00000040065 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm7733-201ENSMUST00000199038 919 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm45722-201ENSMUST00000213075 466 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 4930556G01Rik-201ENSMUST00000128925 891 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm22116-201ENSMUST00000158791 141 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm8993-201ENSMUST00000182182 983 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc89Q9DA73 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms