Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1312-201ENSMUST00000099600 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Acsm3-203ENSMUST00000106527 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r217-203ENSMUST00000228656 9767 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Clec2e-201ENSMUST00000032258 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr377-ps1-201ENSMUST00000134011 1136 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm14092-201ENSMUST00000136794 617 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm5050-201ENSMUST00000197164 775 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mup14-202ENSMUST00000075206 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Rprd1bQ9CSU0 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms