Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Olfr635-201ENSMUST00000098185 966 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Tmem45a-201ENSMUST00000023435 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Olfr102-201ENSMUST00000169373 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm8419-201ENSMUST00000189886 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 A730045E13Rik-201ENSMUST00000066740 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 n-R5s215-201ENSMUST00000082480 104 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm7995-201ENSMUST00000089789 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 4930539J05Rik-201ENSMUST00000181619 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Prpf39Q8K2Z2 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms