Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm5692-201ENSMUST00000187254 1057 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm43762-201ENSMUST00000201521 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 CT010453.2-201ENSMUST00000227005 483 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Lipm-201ENSMUST00000025685 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Far1-202ENSMUST00000067929 4935 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Q8BGC1 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Olfr1115-204ENSMUST00000217196 2109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm9005-201ENSMUST00000119908 607 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm19033-201ENSMUST00000208516 964 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm19921-201ENSMUST00000210505 703 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Q8BGC1 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Gm11826-201ENSMUST00000118781 438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Gm15471-201ENSMUST00000145893 625 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Q8BGC1 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms