Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm43382-201ENSMUST00000198954 838 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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Rbbp4Q60972 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm22599-201ENSMUST00000157597 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm24435-201ENSMUST00000157886 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 1700023F02Rik-202ENSMUST00000188279 412 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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Rbbp4Q60972 CT009515.3-201ENSMUST00000226509 671 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Olfr467-201ENSMUST00000084756 927 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Nebl-213ENSMUST00000177966 1690 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms