Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 CT030238.4-203ENSMUST00000227343 836 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r54-201ENSMUST00000058039 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Amelx-201ENSMUST00000066112 802 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14661-201ENSMUST00000152669 2051 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC160105.1-201ENSMUST00000221931 682 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Prelid2-201ENSMUST00000070949 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Defa17-201ENSMUST00000079528 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm25846-201ENSMUST00000158013 135 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm9480-201ENSMUST00000198038 616 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Spint3-201ENSMUST00000099097 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC124579.1-201ENSMUST00000223468 2520 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms