Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Cd180-204ENSMUST00000171267 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r102-201ENSMUST00000171741 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Trps1-207ENSMUST00000184885 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Arhgef9-203ENSMUST00000113878 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm7073-203ENSMUST00000190178 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Il15ra-213ENSMUST00000135341 1545 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm29678-201ENSMUST00000193966 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC122305.3-201ENSMUST00000214762 361 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Q3U6N9 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm36186-201ENSMUST00000200820 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Fcrl6-201ENSMUST00000094303 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Swi5-204ENSMUST00000113400 522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Q3U6N9 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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