Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr453-202ENSMUST00000213997 3082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r176-201ENSMUST00000171073 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm29815-201ENSMUST00000202418 178 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm3266-201ENSMUST00000217832 591 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC159297.1-201ENSMUST00000218689 290 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC156025.2-201ENSMUST00000225907 1533 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Epyc-202ENSMUST00000105285 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Klrk1-205ENSMUST00000168919 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Cntn4-201ENSMUST00000079416 2844 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Zkscan8-204ENSMUST00000224362 6954 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ryr3-204ENSMUST00000134358 14958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ifi205-201ENSMUST00000059226 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Il1b-201ENSMUST00000028881 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4764-201ENSMUST00000130207 1233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm25219-201ENSMUST00000157545 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms