Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12731-201ENSMUST00000120932 268 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm17024-201ENSMUST00000165676 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm38413-201ENSMUST00000197852 348 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm42646-201ENSMUST00000202233 914 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr663-201ENSMUST00000209914 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Tpbpb-202ENSMUST00000223698 746 ntAPPRIS P2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr137-202ENSMUST00000213505 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Adam6b-201ENSMUST00000063317 2547 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm16180-201ENSMUST00000128662 312 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm32507-201ENSMUST00000209552 437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm22971-201ENSMUST00000083305 97 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cdk14-202ENSMUST00000115450 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Trim71Q1PSW8 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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