Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Ints12-201ENSMUST00000029650 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
Rpl28P41105 Cdh7-203ENSMUST00000129923 1409 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rps11-ps5-201ENSMUST00000117302 472 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11902-201ENSMUST00000118849 270 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm30498-201ENSMUST00000204033 615 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Tas2r108-201ENSMUST00000038750 1013 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Obox7-203ENSMUST00000183788 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 A730081D07Rik-201ENSMUST00000153685 1804 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm34921-201ENSMUST00000219528 1406 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm11852-201ENSMUST00000120806 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm15902-201ENSMUST00000146949 469 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Rpl28P41105 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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