Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm26665-201ENSMUST00000181378 839 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC171206.1-201ENSMUST00000213612 213 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC140409.4-201ENSMUST00000215757 538 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm44530-201ENSMUST00000207920 3559 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Pifo-201ENSMUST00000010280 956 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Cetn2-202ENSMUST00000114550 1124 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm13506-201ENSMUST00000120391 1083 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ear-ps2-201ENSMUST00000100689 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm12413-201ENSMUST00000121508 312 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm24382-201ENSMUST00000122698 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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