Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28837-201ENSMUST00000190397 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm3139-203ENSMUST00000202642 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm5454-201ENSMUST00000052030 1453 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 CT009480.3-201ENSMUST00000224051 3032 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm3669-204ENSMUST00000140946 764 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm4373-201ENSMUST00000178571 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Gm2056J3QQ02 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms