Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Ccdc6D3YZP9 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mdga2-213ENSMUST00000223141 2850 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Hdac9-201ENSMUST00000110819 4413 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm9173-201ENSMUST00000198054 400 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr588-ps1-202ENSMUST00000210115 912 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Prl3b1-201ENSMUST00000035273 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Cntn5-202ENSMUST00000160216 4192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm12181-201ENSMUST00000121448 531 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm22204-201ENSMUST00000122654 327 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Klkb1-201ENSMUST00000026907 5249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Ccdc6D3YZP9 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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