Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Cfap70-202ENSMUST00000022349 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Plcb4-202ENSMUST00000110109 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mir290a-201ENSMUST00000104627 83 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11821-201ENSMUST00000117335 979 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Serpina3e-ps-201ENSMUST00000165968 1228 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm37004-201ENSMUST00000193021 683 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm45064-201ENSMUST00000208619 443 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 AC161252.2-201ENSMUST00000224978 374 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Lcn12-201ENSMUST00000028312 716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mum1l1-202ENSMUST00000113042 4182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr566-203ENSMUST00000213481 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Adh7-201ENSMUST00000090171 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11987-201ENSMUST00000118524 381 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm11910-201ENSMUST00000121624 432 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm23674-201ENSMUST00000157473 131 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm23632-201ENSMUST00000175289 125 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Spocd1B1ASB6 Gm18952-201ENSMUST00000194471 846 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms