Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Mdn1-211ENSMUST00000178134 17959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Tsga10-207ENSMUST00000155852 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm2325-201ENSMUST00000186637 581 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm28507-201ENSMUST00000189737 703 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm38670-201ENSMUST00000199248 77 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr597-201ENSMUST00000098203 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Usp29-203ENSMUST00000198068 4420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 9030204H09Rik-201ENSMUST00000139455 653 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC110381.1-201ENSMUST00000218987 586 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Grik3B1AS29 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms