Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 n-R5s13-201ENSMUST00000093707 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Slc17a3-201ENSMUST00000039721 4276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 9930111J21Rik2-202ENSMUST00000101295 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vmn1r40-205ENSMUST00000228642 2862 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 March1-204ENSMUST00000110253 2748 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 AC079644.3-201ENSMUST00000222452 357 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm18247-201ENSMUST00000222937 601 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Cntn4-202ENSMUST00000089208 5179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Nlrp5-201ENSMUST00000015866 3508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1340-203ENSMUST00000216242 3341 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm6729-202ENSMUST00000219485 2209 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Ccr2-203ENSMUST00000168841 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm9685-201ENSMUST00000211275 538 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 AC101709.1-201ENSMUST00000220276 909 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm42715-201ENSMUST00000189629 12746 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm14849-201ENSMUST00000122293 2846 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Olfr1085-202ENSMUST00000213279 5191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
AgrnA2ASQ1 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
AgrnA2ASQ1 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
AgrnA2ASQ1 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms