Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930547M16Rik-201ENSMUST00000181590 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 n-R5s48-201ENSMUST00000122482 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26528-201ENSMUST00000181965 283 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir7084-201ENSMUST00000183876 70 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm29349-201ENSMUST00000188692 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44861-201ENSMUST00000208325 1220 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC153382.1-201ENSMUST00000217953 1007 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm18601-201ENSMUST00000220831 634 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1020-201ENSMUST00000055840 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr166-201ENSMUST00000074739 1040 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 n-R5s27-201ENSMUST00000093699 119 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Nlrp1a-201ENSMUST00000048514 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Galntl6-207ENSMUST00000204067 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Elovl2-201ENSMUST00000021793 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm15956-201ENSMUST00000153352 502 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
Rabgef1Q9JM13 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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