Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Ugt2b38-201ENSMUST00000072818 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Tsga10-201ENSMUST00000041815 3400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Clstn1Q9EPL2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Gm26742-201ENSMUST00000181829 3340 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Clstn1Q9EPL2 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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