Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm25471-201ENSMUST00000180126 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm9632-201ENSMUST00000195934 643 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4930518I17Rik-201ENSMUST00000203902 656 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5512-202ENSMUST00000220222 1522 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn1r44-206ENSMUST00000226760 2070 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Nbas-201ENSMUST00000042953 7234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC135119.1-202ENSMUST00000228435 2203 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700042G15Rik-203ENSMUST00000152001 583 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Pdzph1-203ENSMUST00000177360 950 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 n-R5s109-201ENSMUST00000179195 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm30676-202ENSMUST00000214464 793 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm5928-201ENSMUST00000221839 466 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms