Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 B930086L07Rik-201ENSMUST00000209529 3738 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm4962-201ENSMUST00000199640 2977 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm45876-201ENSMUST00000212698 2709 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC117608.2-201ENSMUST00000224124 1363 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zfp831-201ENSMUST00000059452 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Rbpj-201ENSMUST00000037618 5459 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm16325-201ENSMUST00000141199 3174 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ccdc82-201ENSMUST00000110583 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 Ktn1-202ENSMUST00000185343 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ktn1-205ENSMUST00000186627 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Bdnf-209ENSMUST00000111050 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 AV026068-206ENSMUST00000187461 513 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.09
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PtprtQ99M80 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Gm45528-201ENSMUST00000209854 3145 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Vmn1r58-204ENSMUST00000228728 9991 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Triml1-201ENSMUST00000059692 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
PtprtQ99M80 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
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