Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37244-201ENSMUST00000191748 1981 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Stk-ps1-201ENSMUST00000173340 1074 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trav1-202ENSMUST00000185651 329 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33178-201ENSMUST00000212090 257 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 CAAA01125382.4-201ENSMUST00000217222 774 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rps26-201ENSMUST00000026420 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tsga13-201ENSMUST00000048580 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Nhlrc3Q8CCH2 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7079-201ENSMUST00000119726 171 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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