Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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Ccdc88cQ6VGS5 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Cypt1-202ENSMUST00000115422 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37882-201ENSMUST00000195254 196 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Ccdc88cQ6VGS5 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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