Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Orm1-201ENSMUST00000030044 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Orm2-201ENSMUST00000075341 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Obox7-201ENSMUST00000069740 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rnf32-201ENSMUST00000001247 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Homez-201ENSMUST00000081162 5609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Olfr537-ps1-202ENSMUST00000210949 2821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Tceal1-201ENSMUST00000055104 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Olfr1122-202ENSMUST00000215371 5036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Olfr378-201ENSMUST00000069790 1508 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Dgkb-203ENSMUST00000220990 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rpgrip1l-201ENSMUST00000047783 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
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Gm28047Q3US59 Vmn1r52-206ENSMUST00000228385 2769 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Usp17lb-201ENSMUST00000076501 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Wdr66-206ENSMUST00000163092 4009 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Pter-203ENSMUST00000134794 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm38412-201ENSMUST00000199205 3895 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm37951-201ENSMUST00000192963 3032 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Neto2-203ENSMUST00000209479 4936 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm4991-201ENSMUST00000118899 1552 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Gm28047Q3US59 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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