Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm9408-201ENSMUST00000197375 1505 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Catsperg1-212ENSMUST00000169143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43386-201ENSMUST00000199654 4001 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18066-201ENSMUST00000210904 1774 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rbm46-202ENSMUST00000182637 2058 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Rnf148-201ENSMUST00000104979 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43054-201ENSMUST00000199495 884 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Pth-201ENSMUST00000079793 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Spata1-206ENSMUST00000197980 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37056-201ENSMUST00000192141 1865 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Olfr1444-202ENSMUST00000213606 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm8061-201ENSMUST00000122380 350 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1700048M11Rik-201ENSMUST00000132861 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Vmn1r57-201ENSMUST00000170780 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 5033404E19Rik-201ENSMUST00000192616 630 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm37235-201ENSMUST00000195171 59 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm42581-201ENSMUST00000201774 966 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18599-201ENSMUST00000206729 1125 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Trafd1Q3UDK1 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms