Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr1225-201ENSMUST00000188861 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 1700020G17Rik-203ENSMUST00000191286 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm31749-201ENSMUST00000206873 598 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm17994-201ENSMUST00000209260 533 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm2225-201ENSMUST00000209570 377 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm17997-201ENSMUST00000211801 840 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr809-203ENSMUST00000218237 1100 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Tmed11-201ENSMUST00000004943 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm15189-201ENSMUST00000121164 1966 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr979-202ENSMUST00000215523 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Psd3-214ENSMUST00000212960 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm15457-201ENSMUST00000129513 3990 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm45066-201ENSMUST00000207528 2551 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Mfap1a-201ENSMUST00000089926 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm8180-201ENSMUST00000163599 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccbe1Q3MI99 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms