Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37221-201ENSMUST00000194472 3007 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm22895-201ENSMUST00000157508 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm4374-201ENSMUST00000204929 424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1382-203ENSMUST00000213707 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1382-204ENSMUST00000213899 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1382-205ENSMUST00000217564 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37114-201ENSMUST00000195065 1804 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Igkv1-99-201ENSMUST00000103326 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zfp389-201ENSMUST00000118425 675 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 1700047N06Rik-201ENSMUST00000194474 920 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44232-201ENSMUST00000204537 225 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ube2n-201ENSMUST00000099329 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Lair1-203ENSMUST00000086401 2496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm19272-201ENSMUST00000184133 1753 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm44209-201ENSMUST00000204556 4153 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Abcb7-201ENSMUST00000033695 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Dnah8-201ENSMUST00000170651 14583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Nlgn1-203ENSMUST00000191835 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Olfr736-205ENSMUST00000215263 2255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Trim71Q1PSW8 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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