Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Svs2-202ENSMUST00000109374 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Ppp1r3b-201ENSMUST00000070481 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Wdr35-202ENSMUST00000111113 4312 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr118-201ENSMUST00000122036 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm42963-201ENSMUST00000202943 1217 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr674-ps1-201ENSMUST00000209383 946 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930452L12Rik-201ENSMUST00000220158 785 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC165260.1-201ENSMUST00000224127 683 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC154806.3-201ENSMUST00000227376 439 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 9930111J21Rik2-201ENSMUST00000093152 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 9930111J21Rik1-201ENSMUST00000093153 2403 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Adar-201ENSMUST00000029563 3753 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm25916-201ENSMUST00000104263 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms