Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm27512-201ENSMUST00000175328 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm18242-201ENSMUST00000218455 542 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 2310030G06Rik-201ENSMUST00000034564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1392-206ENSMUST00000215861 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Pramel5-202ENSMUST00000105752 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Zfp317-202ENSMUST00000208694 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37716-201ENSMUST00000193553 947 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC154472.2-201ENSMUST00000221186 288 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Tet1-206ENSMUST00000174189 14369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Cntnap5c-201ENSMUST00000076038 3931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Muc15-203ENSMUST00000111017 3095 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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