Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir3473g-201ENSMUST00000183494 136 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28526-201ENSMUST00000187731 419 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm18865-201ENSMUST00000193011 1171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC154636.1-201ENSMUST00000223226 126 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm43062-201ENSMUST00000196302 1319 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm28322-201ENSMUST00000185627 1475 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Cyp2c70-201ENSMUST00000051846 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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PdgfraP26618 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Btf3l4-202ENSMUST00000102740 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm24886-201ENSMUST00000104384 123 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
PdgfraP26618 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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