Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm11903-201ENSMUST00000118958 727 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm12929-201ENSMUST00000122406 370 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm15788-201ENSMUST00000130123 613 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm15239-201ENSMUST00000150690 603 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Sh3bgr-207ENSMUST00000171181 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm9047-201ENSMUST00000171317 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm17786-201ENSMUST00000182000 427 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm27976-201ENSMUST00000183635 162 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm9114-201ENSMUST00000188558 997 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm44538-201ENSMUST00000205615 348 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm44856-201ENSMUST00000206639 304 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm5791-201ENSMUST00000220840 489 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm19238-201ENSMUST00000221936 1260 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Sprr2j-ps-201ENSMUST00000029533 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr794-201ENSMUST00000059957 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr347-201ENSMUST00000078761 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm24405-201ENSMUST00000083033 167 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm17056-201ENSMUST00000164804 2299 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Morc1-201ENSMUST00000023330 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Smim15-201ENSMUST00000095458 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Trpm3-202ENSMUST00000074770 6710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm4876-203ENSMUST00000139701 2225 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Mobp-203ENSMUST00000111627 481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Rpl9-ps9-201ENSMUST00000173020 573 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm20453-201ENSMUST00000173968 226 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PdgfaP20033 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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