Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rbpj-202ENSMUST00000087360 5252 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Heph-203ENSMUST00000113838 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mir133b-201ENSMUST00000083546 119 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph4a-201ENSMUST00000169670 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 G6pd2-201ENSMUST00000053876 2348 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC156569.1-201ENSMUST00000222020 3841 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42437-201ENSMUST00000197263 923 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7688-201ENSMUST00000212857 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Trim5-202ENSMUST00000098179 3655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r219-202ENSMUST00000226845 5979 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r219-205ENSMUST00000228666 5993 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36814-201ENSMUST00000197457 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Abcd2-201ENSMUST00000069511 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc1-203ENSMUST00000102602 751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 1700006E09Rik-201ENSMUST00000010985 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45215-201ENSMUST00000206407 395 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc72-201ENSMUST00000020853 660 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23514-201ENSMUST00000082827 130 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms