Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm6288-201ENSMUST00000100778 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Ptprtos-201ENSMUST00000151688 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm28792-201ENSMUST00000191482 419 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm43392-201ENSMUST00000196560 434 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm44580-201ENSMUST00000206333 877 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Olfr65-202ENSMUST00000209528 1106 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Tom1l1-204ENSMUST00000107869 1826 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Cdk14-201ENSMUST00000030763 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Gm4922-201ENSMUST00000055107 1950 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Rbbp4Q60972 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm15892-201ENSMUST00000152627 439 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm26898-201ENSMUST00000181678 384 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Rbbp4Q60972 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms