Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm42559-201ENSMUST00000201811 3532 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps11-201ENSMUST00000176568 2730 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44886-201ENSMUST00000209009 1304 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r214-202ENSMUST00000227236 3892 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm6427-201ENSMUST00000118721 979 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14620-201ENSMUST00000120656 383 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15792-201ENSMUST00000137099 769 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Mir1981-201ENSMUST00000157934 82 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm16184-201ENSMUST00000162324 573 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5218-201ENSMUST00000172270 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm4152-201ENSMUST00000172675 259 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 1700066J03Rik-201ENSMUST00000181908 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Mir6930-201ENSMUST00000183859 68 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ighv8-3-201ENSMUST00000194985 295 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr563-ps1-201ENSMUST00000210909 873 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC112680.2-201ENSMUST00000213119 595 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Pln-203ENSMUST00000218468 760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm4953-201ENSMUST00000077309 483 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp955b-201ENSMUST00000099414 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cfap97-201ENSMUST00000034048 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm12506-201ENSMUST00000123620 806 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm8550-201ENSMUST00000161621 653 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20625-201ENSMUST00000177065 698 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm3500-202ENSMUST00000178058 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 2010016I18Rik-203ENSMUST00000189683 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29999-202ENSMUST00000193554 671 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC122844.1-201ENSMUST00000195971 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44412-201ENSMUST00000203018 294 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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