Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm12784-202ENSMUST00000206001 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Ceacam5-201ENSMUST00000081907 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Gm43361-201ENSMUST00000196562 4690 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Klhdc9Q3USL1 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Klhdc9Q3USL1 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Skil-201ENSMUST00000029194 6717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Klhdc9Q3USL1 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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Klhdc9Q3USL1 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Trp53inp1-201ENSMUST00000029865 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm12444-201ENSMUST00000121512 877 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Klhdc9Q3USL1 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms