Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37830-201ENSMUST00000195282 837 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm4012-201ENSMUST00000221504 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 4930578G10Rik-201ENSMUST00000068158 614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Cd200r3-203ENSMUST00000114611 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vcan-203ENSMUST00000109546 12427 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Ascc3-206ENSMUST00000219226 1357 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 G530011O06Rik-201ENSMUST00000154810 2380 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Txndc9-201ENSMUST00000162031 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm4070-201ENSMUST00000106766 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gvin1-201ENSMUST00000006667 8795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm37217-201ENSMUST00000194017 3521 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm15747-201ENSMUST00000141216 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm4874-201ENSMUST00000203589 691 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm45777-201ENSMUST00000213009 301 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Q3U6N9 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms