Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14375-201ENSMUST00000119490 855 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25271-201ENSMUST00000157273 290 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10177-201ENSMUST00000160052 444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24561-201ENSMUST00000175182 95 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 D630011A20Rik-201ENSMUST00000180858 500 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccndbp1Q3TVC7 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccndbp1Q3TVC7 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccndbp1Q3TVC7 CT485607.3-201ENSMUST00000213361 672 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Ccndbp1Q3TVC7 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr558-201ENSMUST00000094124 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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