Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 n-R5s201-201ENSMUST00000122622 116 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm37758-201ENSMUST00000194275 629 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 AC113031.1-201ENSMUST00000227400 432 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Usp39Q3TIX9 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Mug1-201ENSMUST00000032228 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Slc24a2-204ENSMUST00000107158 10499 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Slco6b1-202ENSMUST00000178359 1778 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8250-201ENSMUST00000117398 774 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 AI847159-203ENSMUST00000141786 915 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps58-201ENSMUST00000174460 840 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10717-206ENSMUST00000177875 675 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm10717-207ENSMUST00000179264 672 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm44876-201ENSMUST00000205394 670 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Usp39Q3TIX9 Gm18805-201ENSMUST00000206872 655 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms