Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1047-202ENSMUST00000216056 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Rap2c-201ENSMUST00000053593 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Map7d3-201ENSMUST00000114766 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm12094-201ENSMUST00000121781 472 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC137117.1-201ENSMUST00000226912 441 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AY512931-201ENSMUST00000139751 2395 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC139350.2-201ENSMUST00000226508 2331 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 1110059G10Rik-201ENSMUST00000035154 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pabpc4l-201ENSMUST00000166505 5218 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Tmprss11a-201ENSMUST00000101073 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Sim1-201ENSMUST00000020071 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pglyrp3-201ENSMUST00000047660 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm46348-201ENSMUST00000222917 2151 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1015-203ENSMUST00000215945 2479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1219-205ENSMUST00000217421 5849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Mir7658-201ENSMUST00000184043 57 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm6362-201ENSMUST00000217686 836 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 AC158803.3-201ENSMUST00000220024 211 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Med12-204ENSMUST00000117706 6940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PtprmP28828 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm43629-201ENSMUST00000201782 704 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
PtprmP28828 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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