Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mipepos-201ENSMUST00000155855 610 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 7530428D23Rik-201ENSMUST00000191725 765 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm18851-201ENSMUST00000210087 1058 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm25799-201ENSMUST00000082643 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gml-201ENSMUST00000096400 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Zfp945-201ENSMUST00000088696 4285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RxraP28700 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RxraP28700 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28082-201ENSMUST00000185683 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29158-201ENSMUST00000186883 1494 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29219-201ENSMUST00000187224 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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RxraP28700 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29616-201ENSMUST00000188777 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29162-202ENSMUST00000188893 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28606-201ENSMUST00000188938 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29338-201ENSMUST00000189318 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29425-202ENSMUST00000189421 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29271-203ENSMUST00000189943 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28318-203ENSMUST00000190347 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm43627-201ENSMUST00000197119 2299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm4973-201ENSMUST00000206925 1334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RxraP28700 Gm12099-201ENSMUST00000118660 750 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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