Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm5339-201ENSMUST00000210551 1102 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC109214.2-201ENSMUST00000220089 358 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC166358.3-201ENSMUST00000221456 181 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC125543.4-201ENSMUST00000223385 117 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr1271-201ENSMUST00000099751 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm8700-201ENSMUST00000222187 3054 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm46430-206ENSMUST00000222064 1647 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Kif9-203ENSMUST00000197248 3184 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm14220-201ENSMUST00000118114 449 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr607-201ENSMUST00000119283 915 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm16200-201ENSMUST00000120385 331 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Obox3-ps5-201ENSMUST00000176412 1003 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm3279-201ENSMUST00000203099 1092 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtpraP18052 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms