Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RhoP15409 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Tmc5-201ENSMUST00000057320 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Olfr1503-ps1-201ENSMUST00000076614 803 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Zdhhc17-201ENSMUST00000041723 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RhoP15409 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RhoP15409 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm21761-202ENSMUST00000187530 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r15-201ENSMUST00000228297 2021 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Baz2b-202ENSMUST00000112550 7895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm13579-201ENSMUST00000118519 517 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RhoP15409 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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