Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm45721-201ENSMUST00000212267 607 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC158982.1-205ENSMUST00000227339 1876 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC116724.1-201ENSMUST00000227900 972 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Tnfsf10-201ENSMUST00000046383 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Erc2-208ENSMUST00000210924 4871 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Nusap1-201ENSMUST00000028771 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gramd1c-203ENSMUST00000179565 3159 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm13590-201ENSMUST00000120183 1588 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Zcchc10-201ENSMUST00000018383 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr54-202ENSMUST00000215409 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtprbB2RU80 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Hbb-bh2-201ENSMUST00000106866 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtprbB2RU80 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
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