Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Crem-236ENSMUST00000154715 1167 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Trav12n-3-201ENSMUST00000179583 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 1700101I11Rik-201ENSMUST00000181594 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26579-201ENSMUST00000181656 918 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm28188-201ENSMUST00000190483 236 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 8030487O14Rik-201ENSMUST00000200244 903 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC119892.1-201ENSMUST00000217997 384 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 CT485612.1-201ENSMUST00000222555 382 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Lrriq3-203ENSMUST00000194376 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC153962.3-202ENSMUST00000217778 1412 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Fat4-201ENSMUST00000061260 16109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm6702-201ENSMUST00000208496 471 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC131997.2-201ENSMUST00000227452 362 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm23330-201ENSMUST00000082660 164 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Ssxb5-201ENSMUST00000089370 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Il18rap-201ENSMUST00000027237 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Cyp2c38-201ENSMUST00000035488 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Grik3B1AS29 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms