Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Mir6348-201ENSMUST00000183804 120 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm43436-201ENSMUST00000199308 147 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm43850-201ENSMUST00000202021 578 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm44366-201ENSMUST00000204933 674 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm18781-201ENSMUST00000211252 924 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm30933-201ENSMUST00000217174 381 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 AC105950.1-201ENSMUST00000222637 408 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 AC139568.1-201ENSMUST00000222878 486 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Vmn1r67-201ENSMUST00000055964 999 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Sprr3-201ENSMUST00000058142 1222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Abca15-202ENSMUST00000121265 5335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Abca15-201ENSMUST00000076272 5335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Psd3-206ENSMUST00000120071 9203 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm26745-201ENSMUST00000181022 1874 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm42955-201ENSMUST00000197355 3393 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm20125-201ENSMUST00000185722 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Olfr358-201ENSMUST00000100146 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Trav12n-1-201ENSMUST00000103587 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm14391-202ENSMUST00000109055 965 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Fundc1-203ENSMUST00000142638 597 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm14419-203ENSMUST00000156844 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Trav12d-1-202ENSMUST00000183652 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm27970-201ENSMUST00000184854 407 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Gm44097-201ENSMUST00000204112 563 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
H2-M5A7VMS3 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms