Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm7658-201ENSMUST00000119064 1124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29586-201ENSMUST00000185225 1104 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm28253-201ENSMUST00000186071 712 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29178-203ENSMUST00000186312 1104 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29624-202ENSMUST00000190185 1104 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29179-209ENSMUST00000190621 1100 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fabp9-202ENSMUST00000191678 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37463-201ENSMUST00000193819 796 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm18482-201ENSMUST00000202405 760 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC153821.1-201ENSMUST00000217893 581 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC104906.1-201ENSMUST00000218122 913 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr1181-201ENSMUST00000099823 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Cabyr-203ENSMUST00000119108 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm44169-201ENSMUST00000205133 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC151904.3-201ENSMUST00000219266 895 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC163621.3-201ENSMUST00000221738 1033 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CtcflA2APF3 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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