Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm28078-201ENSMUST00000190381 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm44471-201ENSMUST00000197963 100 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Utp14b-ps1-201ENSMUST00000197716 2265 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Itpr2-202ENSMUST00000079573 11679 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Mrgprc2-ps-201ENSMUST00000188039 1516 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm31520-202ENSMUST00000203574 1524 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1353-201ENSMUST00000039718 1992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm9144-201ENSMUST00000101625 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Mir697-201ENSMUST00000102316 109 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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Hdac5Q9Z2V6 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 AC154270.2-201ENSMUST00000226755 2306 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Tex28-202ENSMUST00000114328 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Kbtbd8-201ENSMUST00000032107 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Zfp27-206ENSMUST00000172448 2460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm23888-201ENSMUST00000122690 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r-ps10-201ENSMUST00000176836 898 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hdac5Q9Z2V6 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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